Stiamo cercando candidati altamente motivati che entrino a far parte del nostro gruppo di Biologia Strutturale Computazionale. Il candidato utilizzerà metodi allo stato dell'arte di intelligenza artificiale e simulazioni avanzate di dinamica molecolare per la progettazione di enzimi iperattivi utilizzati come terapie per i disturbi da accumulo lisosomiale (LSD). Questo progetto mira a superare i principali limiti delle attuali terapie migliorando l'enzima terapeutico, riducendo le dosi richieste e minimizzando gli effetti collaterali. Questo contratto ha lo scopo di preparare il candidato per un potenziale dottorato di ricerca.
Requisiti essenziali:
Esperienza con il linguaggio di programmazione Python e i sistemi operativi basati su Linux.
Familiarità con dinamica molecolare e/o familiarità con metodi di machine learning/deep learning.
Laurea magistrale in fisica, chimica, biologia, informatica o simili.
Alta determinazione e disponibilità a lavorare in un ambiente interdisciplinare e cooperativo.
Buone capacità di comunicazione in inglese.
Preferibile (non essenziale):
Esperienza con metodi di protein design/modelling (es. ProteinMPNN, ESM, Rosettta, etc.)
Esperienza con GROMACS o altri software per dinamica molecolare
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We are seeking a highly motivated condidates to join our Computational Structural Biology group. The candidate will employ state-of-the-art AI-based Protein Design methods and advanced Molecular Dynamics simulations to support the design of enhanced enzymes used as therapies for lysosomal storage disorders (LSD). This project aims to overcome the main limitations of current LSD therapies by improving the potency of the enzyme, reducing the doses required, and minimizing the side effects. This contract is intended to prepare the candidate for a potential transition into a PhD program. This is a full-time in-person position at the Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM), located in Pozzuoli, Naples, Italy.
Essential Requirements:
- Experience with the Python programming language and Linux-based operating systems
- Familiarity with biomolecular simulations and/or familiarity with machine learning/deep learning methods
- Master's degree in physics, chemistry, biology, computer science, or a related field
- High motivation and willingness to work in an interdisciplinary and collaborative environment
- Good English communication skills
Desirable (but not essential):
- Previous experience with AI-based protein design/modelling algorithms (e.g., ProteinMPNN, ESM, Rosetta, etc.)
- Previous experience with GROMACS or other MD software